فصل 2 -بخش D ( ساختار سه بعدی )

ساختار 3D ( سه بعدی ) :

ساختار 3D ( ساختار سه بعدی) ، ساختار سوم نیز خوانده می شود. اگر پروتئین حاوی بیش از یک پلی پپتید باشد ، پروتئین دارای ساختار چهارم نیز می شود که این ساختار در واقع وابستگی میان پلی پپتید های پروتئین ( زیر واحد های آن ) را بیان می کند. ( وابستگی و ارتباط میان زیر واحد ها سبب ایجاد ساختار می شود.)

 

شکل 2-D-1: ساختار 3D آنزیم RNase A که به صورت روبان ( رشته ) نشان داده شده است. ساختار اتمی آن را می توانید از بانک اطلاعات پروتئینی ( PDB ) به دست آورید.( 1RCN= PDB ID )

 

کریستالوگرافی اشعه X و NMR دو تکنیک اصلی آزمایشگاهی برای تعیین ساختار سه بعدی ماکرومولکول ها می باشند. PDB سایت بسیار مهمی برای اطلاعات ساختاری ماکرومولکول ها می باشد که به راحتی به وسیله PDB ID   ( نشانه = ID ) ماکرومولکول ها می توان به آن ها دست یافت .

 

سایت هایی برای علاقمندان :

Crystallography 101 - By Bernhard Rupp

The Basics of NMR - By Joseph P. Hornak

NMR Knowledge Base - From John Wiley & Sons

2D NMR Spectroscopy - By Marc Bria